En los últimos 50 años el lago de Cuitzeo ha sufrido cambios radicales en color, olor, extensión y profundidad. Esta problemática afecta a las poblaciones que dependen directamente del lago, especialmente a los pescadores, pero también tiene consecuencias para la salud, como es el caso de las tolvaneras que producen enfermedades respiratorias. Para atender estas necesidades se estableció una colaboración entre el Instituto Municipal de Planeación del Ayuntamiento de Morelia (IMPLAN) y el Posgrado en Ciencias de la Sustentabilidad de la UNAM Campus Morelia. Derivado de esta colaboración, se desprende el presente trabajo en el cual se aborda 1) la caracterización de los flujos contaminantes que llegan al Lago desde Morelia y la Zona Metropolitana 2) un diagnóstico de la gestión de la cuenca para entender cuáles son los retos y oportunidades para mejorar esta gestión.